Toute habitation reliée à une micro-station doit faire attention à ce qu'elle rejette dans ses effluents. Selon leur nature, ceux-ci peuvent en effet compromettre la bonne stabilité des bactéries présentes dans la micro-station, perdant ainsi en efficacité de traitement des eaux usées.
On pense ainsi aux lingettes, tampons, mégot de cigarette, produits de nettoyage pour WC non-adaptés, peintures, désinfectants, diluants, eaux de ciment, cendres ou encore sable de litière. Autant d'éléments qui peuvent encombrer, bloquer votre micro-station et dans le cas des produits chimiques, détruire leur pouvoir épurateur.